Antoine Marès est titulaire de la chaire d'histoire de l'Europe centrale contemporaine à l'Université de Paris I, après avoir longuement enseigné aux Langues'O et séjourné trois ans à Prague comme directeur du Centre français de recherche en sciences sociales et humaines (CEFRES). Il est président de l'Institut d'études slaves.
Il a notamment publié Thomas Garrigue Masaryk, Européen et humaniste ; Histoire et pouvoir en Europe médiane ; Paris, "capitale culturelle de l'Europe centrale" et Les enjeux de l'histoire en Europe centrale.